జర్నల్ ఆఫ్ మాలిక్యులర్ బయాలజీ అండ్ మెథడ్స్

రొమ్ము క్యాన్సర్ రోగి నుండి సాధారణ కణజాలంలో పోస్ట్-జైగోటిక్ మొజాయిక్ మ్యుటేషన్

ర్యాంగ్ నామ్ కిమ్

అనేక మునుపటి పరిశోధనలు క్యాన్సర్ కణజాలాలలో సోమాటిక్ డ్రైవర్ మ్యుటేషన్‌లపై తాజా వెలుగును నింపినప్పటికీ, సాధారణం నుండి క్యాన్సర్ కణజాలాలకు మ్యుటేషన్-ఆధారిత ప్రాణాంతక పరివర్తన విధానం ఇప్పటికీ రహస్యంగానే ఉంది. ఈ అధ్యయనంలో, రొమ్ము క్యాన్సర్‌కు దారితీసే పోస్ట్-జైగోటిక్ మొజాయిక్ మ్యుటేషన్‌ను వివరించడానికి మేము 12 మంది రొమ్ము క్యాన్సర్ రోగుల నుండి జత చేసిన సాధారణ మరియు క్యాన్సర్ నమూనాల మొత్తం ఎక్సోమ్ విశ్లేషణను చేసాము. మేము సాధారణ కణజాలంలో 2% వేరియంట్ అల్లెల్ భిన్నం (VAF)తో పోస్ట్-జైగోటిక్ మొజాయిక్ మ్యుటేషన్ PIK3CA p.F1002Cని కనుగొన్నాము, సరిపోలిన రొమ్ము క్యాన్సర్ కణజాలంలో సంబంధిత VAF 20.6% పెరిగింది. సరిపోలిన క్యాన్సర్ కణజాలంలో వేరియంట్ యుగ్మ వికల్ప భిన్నం యొక్క అటువంటి విస్తరణ రొమ్ము క్యాన్సర్‌కు అంతర్లీనంగా ఉన్న కారణానికి అనుబంధంగా మొజాయిక్ మ్యుటేషన్‌ను సూచించవచ్చు. పోస్ట్-జైగోటిక్ మొజాయిక్ మ్యుటేషన్ బాగా స్థిరపడిన వేరియంట్ ఉల్లేఖన సాఫ్ట్‌వేర్ ప్రోగ్రామ్‌ల ద్వారా హానికరంగా ఉంటుందని అంచనా వేయబడింది, SIFT_pred, Polyphen2_HDIV_pred, Polyphen2_HVAR_pred, LRT_pred, MutationTaster_pred, PROVEAN_pred, Fathmm. MKL_coding_pred, MetaSVM_pred మరియు MetaLR_pred. అదనంగా, మేము ఆ రోగులలో 22 స్టాప్-గెయిన్, 12 స్ప్లికింగ్ సైట్, 13 ఫ్రేమ్ షిఫ్ట్ మరియు 7 పర్యాయపదాలు లేని మ్యుటేషన్‌లతో సహా 61 హానికరమైన మరియు వ్యాధికారక ఉత్పరివర్తనాలను కనుగొన్నాము. పరస్పర సంతకం విశ్లేషణ చేయడం ద్వారా, మేము APOBEC సైటిడినెడిమినేస్ మరియు లోపభూయిష్ట DNA అసమతుల్యత మరమ్మత్తుతో సహా రొమ్ము క్యాన్సర్ కారకాలకు సంబంధించిన మూడు పరస్పర సంతకాలను గుర్తించాము. కలిసి చూస్తే, ఈ ఫలితాలు సోమాటిక్ డ్రైవర్ మ్యుటేషన్‌లతో పాటు, పోస్ట్-జైగోటిక్ మొజాయిక్ మ్యుటేషన్ ఒక క్లిష్టమైన లక్ష్యం కావచ్చు, ఇది రాబోయే భవిష్యత్తులో రొమ్ము క్యాన్సర్‌కు అంతర్లీనంగా ఉన్న కారణాన్ని నిర్ధారించడంలో ముందస్తు శ్రద్ధ అవసరం.