జర్నల్ ఆఫ్ అప్లైడ్ బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ & కంప్యూటేషనల్ బయాలజీ

హోమోలజీ మోడలింగ్

హోమోలజీ మోడలింగ్, లేకపోతే ప్రోటీన్ యొక్క కంపారిటివ్ మోడలింగ్ అని పిలుస్తారు, దాని అమైనో తినివేయు వారసత్వం నుండి "ఆబ్జెక్టివ్" ప్రోటీన్ యొక్క న్యూక్లియర్ డెటర్మినేషన్ మోడల్‌ను అభివృద్ధి చేయడాన్ని సూచిస్తుంది. హోమోలజీ మోడలింగ్‌లో మేము సంబంధిత హోమోలాగస్ ప్రోటీన్ ("లేఅవుట్") యొక్క త్రిమితీయ నిర్మాణాన్ని పరీక్షిస్తాము. "హోమోలజీ డెమోన్‌స్ట్రేటింగ్" అనే వ్యక్తీకరణ, సారూప్య డిస్‌ప్లేయింగ్ లేదా ఫార్మాట్ ఆధారిత డిస్‌ప్లేయింగ్ (TBM) అని కూడా పిలుస్తారు, ఇది ఒక హోమోలాగస్ ప్రోటీన్ యొక్క తెలిసిన తాత్కాలికంగా నిర్ణయించబడిన నిర్మాణాన్ని లేఅవుట్‌గా ఉపయోగించి ప్రోటీన్ 3D నిర్మాణాన్ని ప్రదర్శించడాన్ని సూచిస్తుంది.

ప్రొటీన్ నిర్మాణం, ప్రొటీన్ సామర్థ్యం, ​​పురోగతి, లిగాండ్‌లు మరియు విభిన్న ప్రొటీన్‌లతో సహకారాలు మరియు ఫార్మాస్యూటికల్ పరిశ్రమ లోపల కూడా స్ట్రక్చర్ ఆధారిత మందుల బహిర్గతం మరియు మందుల రూపురేఖల పరిశోధనలో అద్భుతంగా సహాయపడుతుంది. హోమోలజీ డిస్ప్లేయింగ్ పరమాణు పరిశోధకుడికి మరియు సేంద్రీయ రసాయన శాస్త్రవేత్తలకు "తక్కువ-నిర్ణయం" నిర్మాణాలను అందించగలదు, ఇది ప్రోటీన్‌లోని ముఖ్యమైన నిక్షేపాల యొక్క ప్రాదేశిక చర్య గురించి తగిన డేటాను కలిగి ఉంటుంది మరియు ఇది కొత్త పరిశోధనల రూపురేఖలను నిర్దేశిస్తుంది.

ఉదాహరణకు, అటువంటి "తక్కువ-నిర్ణయం" నమూనా నిర్మాణాలను ఉపయోగించగలిగితే సైట్-కోఆర్డినేటెడ్ మ్యూటాజెనిసిస్ విశ్లేషణల రూపురేఖలు గణనీయంగా మెరుగుపరచబడతాయి. ప్రోటీన్ నిర్మాణం యొక్క ట్రయల్ ఇలస్ట్రేషన్ తరచుగా ప్రోటీన్ యొక్క తగినంత కొలత (క్లోనింగ్, ఎక్స్‌ప్రెషన్ మరియు మిల్లీగ్రామ్ మొత్తాలను నిర్వీర్యం చేయడం), క్రిస్టలైజేషన్‌తో అనుసంధానించబడిన సవాళ్ల ద్వారా వాయిదా వేయవచ్చు మరియు ప్రోటీన్ స్ఫటికాకార భాగం కూడా సమస్యల మూలంగా మారవచ్చు. ఈ నేపధ్యంలో, ప్రోటీన్ నిర్మాణం యొక్క సూచనను నిర్వహించే వ్యవస్థలు చాలా అభిరుచిని పెంచుకోవడం ఆశ్చర్యకరం కాదు. ఈ టెక్నిక్‌లలో, హోమోలజీని ఎక్కువగా ప్రదర్శించే వ్యూహం అత్యంత నమ్మదగిన ఫలితాన్ని ఇస్తుంది. రెండు ప్రొటీన్‌లు ఒకే కుటుంబంతో ఒక స్థానాన్ని కలిగి ఉండటం మరియు తులనాత్మక అమైనో తినివేయు వారసత్వాలను కలిగి ఉండటం, తులనాత్మక త్రిమితీయ నిర్మాణాలను కలిగి ఉంటాయని ఈ సాంకేతికత యొక్క ఉపయోగం.